This README.md was forked from: https://github.com/haruosuz/bioinfo/blob/master/2023/CaseStudy.md
https://biosciencedbc.jp/event/ajacs/ajacs99.html
オンラインで使える統計解析ツールを知って・学んで・使う（AJACSオンライン18）
14:50～15:50 Posit Cloud (旧：RStudio) を用いて生物配列データ解析に取り組む
この講義では、Posit Cloud (旧：RStudio) を利用してバイオインフォマティクスに取り組みます。具体的には、SeqinR パッケージなどを使用し、生物のゲノム・遺伝子 (核酸塩基)・タンパク質 (アミノ酸) の配列データ解析を学びます。
準備
Posit Cloud の無料アカウントを作成する。
参考: "RStudio Cloud を使ってウェブブラウザ上でR(Studio)を利用する" https://doi.org/10.7875/togotv.2021.022
演習
https://posit.cloud/content/7010996 プロジェクトにアクセスする。「Save a Permanent Copy」ボタンを押して、自分用にプロジェクトのコピーを保存する。
参考: https://posit.cloud/learn/guide
Rスクリプトを開く。
- my_0_setup.R
- my_seqinr_dna.R
- my_seqinr_dotplot.R
コマンドを実行するには
- "Run"コマンドを使用する。
- キーボード・ショートカット Cmd/Ctrl + Enter を押す。
- "Compile Report"コマンドを使用する。