Dockerfile

# FROM python: "3.10-alpine"

FROM continuumio/miniconda3
LABEL maintainer="Hector M. Sanchez C. <sanchez.hmsc@berkeley.edu>"
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# Setup Structure
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RUN apt-get update \
    && apt-get install nano \
    && apt-get install gcc -y \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/* \
    && mkdir MGSurvE
WORKDIR /MGSurvE
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# Copy Requirements and License
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COPY ./conda/requirements.yml . 
COPY LICENSE .
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# Copy Paper and Demo Experiments Files
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COPY ./MGSurvE/ .
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# Install Packages
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RUN conda update -n base -c defaults conda \
    && conda config --set offline false \
    && conda config --add channels conda-forge \
    && conda config --add channels bioconda \
    && conda install -n base conda-libmamba-solver \
    && conda config --set solver libmamba \
    && conda install gdal fiona pyproj cartopy libpysal -y \
    && conda install -c conda-forge deap nodejs osmnx basemap-data-hires -y \ 
    && pip install MGSurvE