IFB-core-cluster_access.Rmd

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title: "Travailler sur le cluster de l'IFB"
author: "Jacques van Helden, Julien Seiler et Gildas Lecorguillé"
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subtitle: DUBii 2019
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```

## Connexion

```bash
ssh <username>@core.cluster.france-bioinformatique.fr
```
*(remplacez `<username>`) par votre propre nom d'usager sur le cluster.*

## Organisation des dossiers

### Votre dossier personnel

Chaque usager dispose d'un compte personnel identifié par la variable d'environnement `${HOME}` ou le symbole `~`.

```bash
# Print the path to your HOME folder
echo ${HOME}
echo ~        # equivalent result

# Go to your home folder
cd ${HOME}
cd ~       # equivalent
```


### Votre dossier projet

Pour le DU-Bii, chaque apprenant dispose en outre d'un dossier projet, qui sera partagé -- uniquement pendant le temps de la formation -- entre lui, son tuteur sur la plateforme d'accueil IFB, et son encadrant académique. 

`/shared/projects/du_bii_2019/<username>`

*(remplacez `<username>`) par votre propre nom d'usager sur le cluster.*

### L'espace partagé pour tous les participants

Nous avons en outre créé un espace partagé par tous les aprticipants de la formation. Cet espace est accessible

- en écriture pour les formateurs
- en lecture pour les apprenants

```bash
ls -1 /shared/projects/du_bii_2019/data/
```