-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
main.py
156 lines (135 loc) · 8.81 KB
/
main.py
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
import streamlit as st
import json
from functions import *
def main(config : dict):
st.set_page_config(
page_title="get_VECG",
page_icon='configs/logo.png',
layout="wide",
initial_sidebar_state="expanded",)
st.title("Получение ВЭКГ")
uploaded_file = st.sidebar.file_uploader("Выберите файл .edf", type="edf")
if uploaded_file:
st.write(f"Выбран файл: {uploaded_file.name}")
st.markdown('---')
n_term_start = st.sidebar.number_input("Номер периода ЭКГ", value=config['n_term_start'], min_value=2)
button_pressed = st.sidebar.button(":red[Запуск]", key="launch_button",
help="Нажмите, чтобы начать обработку данных", use_container_width=True)
st.sidebar.markdown('---')
st.sidebar.markdown('### Выбор режимов:')
plot_projections = st.sidebar.checkbox("Построение проекций ВЭКГ", value=config['plot_projections'])
plot_3D = st.sidebar.checkbox("Построение 3D ВЭКГ", value=config['plot_3D'])
show_ECG = st.sidebar.checkbox("Отображение ЭКГ отведений", value=config['show_ECG'])
show_xyz = st.sidebar.checkbox("Отображение ВЭКГ отведений", value=config['show_xyz'])
predict_res = st.sidebar.checkbox("Результат СППР (болен/здоров)", value=config['predict_res'])
count_qrst_angle = st.sidebar.checkbox("Расчет угла QRST", value=config['count_qrst_angle'])
QRS_loop_area = st.sidebar.checkbox("Расчет площади QRS петли", value=config['QRS_loop_area'])
T_loop_area = st.sidebar.checkbox("Расчет площади ST-T петли", value=config['T_loop_area'])
st.sidebar.markdown('---')
st.sidebar.markdown('### Настройки:')
mean_filter = st.sidebar.checkbox("Сглаживание петель", value=config['mean_filter'])
filt = st.sidebar.checkbox("ФВЧ фильтрация ЭКГ сигналов", value=config['filt'])
if filt:
f_sreza = st.sidebar.number_input("Частота среза ФВЧ фильтра (в Гц)", value=config['f_sreza'], min_value=0.0)
f_sampling = st.sidebar.number_input("Частота дискретизации (в Гц)", value=config['f_sampling'], min_value=1)
pr_delta = st.sidebar.number_input("Сдвиг от R пика (в долях от размера кардиоцикла)",
value=config['pr_delta'], min_value=0.00, max_value=1.0)
# Показать только при dev_mode логи обработки
if config["dev_mode"]:
logs = st.sidebar.checkbox("Показ логов обработки", value=config['logs']) # Показать только при dev_mode
else:
logs = False
st.sidebar.markdown('---')
if button_pressed:
if uploaded_file is not None:
temp_file_path = "temp.edf" # Имя временного файла
with open(temp_file_path, "wb") as temp_file:
temp_file.write(uploaded_file.read())
#st.write(f'Загружен файл - {temp_file_path}')
input_data = {
"data_edf": temp_file_path,
"n_term_start": n_term_start,
"filt": filt,
"f_sreza": f_sreza if filt else None,
"f_sampling": f_sampling,
"plot_projections": plot_projections,
"plot_3d": plot_3D,
"show_ecg": show_ECG,
"predict": predict_res,
"count_qrst_angle": count_qrst_angle,
"qrs_loop_area": QRS_loop_area,
"t_loop_area": T_loop_area,
"mean_filter": mean_filter,
"logs": logs,
"n_term_finish": None,
"pr_delta": pr_delta,
"show_xyz": show_xyz,
"save_coord": False
}
# Получить ВЭКГ (запуск гланой функции)
try:
output = get_VECG(input_data)
# Выделение текстовых ответов и plotly графиков
res = output['text']
charts = output['charts']
except ValueError as e:
# Обработка ошибок
st.error("Для данного выбранного периода площади не могут быть посчитаны.")
st.warning("Измените значение номера периода или отключите режим вычисления площадей.")
if config["dev_mode"]:
st.write(f"Код ошибки: {e}")
res = ()
charts = []
# Очиста временных файлов после инференса
os.remove(temp_file_path)
#st.write(f'Удален файл - {temp_file_path}')
# Обработаем результаты программы, поместив в список предложения:
message = []
error = False
if res == 'no_this_period':
st.error("Не найден такой период. Попробуйте ввести меньше значение")
error = True
elif res == 'too_noisy':
st.error("Не получилось построить ВЭКГ, так как ЭКГ слишком шумный")
error = True
elif len(res) == 4:
area_projections, angle_qrst, angle_qrst_front, message_predict = res
if input_data["predict"]:
message.append('__СППР: ' + message_predict)
if input_data["qrs_loop_area"]:
message.append(f'Площадь петли QRS во фронтальной плоскости: {"{:.3e}".format(area_projections[0])}')
message.append(f'Площадь петли QRS во сагиттальной плоскости: {"{:.3e}".format(area_projections[1])}')
message.append(f'Площадь петли QRS во аксиальной плоскости: {"{:.3e}".format(area_projections[2])}')
if input_data["qrs_loop_area"] and input_data["t_loop_area"]:
message.append(f'Площадь петли ST-T во фронтальной плоскости: {"{:.3e}".format(area_projections[3])}')
message.append(f'Площадь петли ST-T во сагиттальной плоскости: {"{:.3e}".format(area_projections[4])}')
message.append(f'Площадь петли ST-T во аксиальной плоскости: {"{:.3e}".format(area_projections[5])}')
elif input_data["t_loop_area"]:
message.append(f'Площадь петли ST-T во фронтальной плоскости: {"{:.3e}".format(area_projections[0])}')
message.append(f'Площадь петли ST-T во сагиттальной плоскости: {"{:.3e}".format(area_projections[1])}')
message.append(f'Площадь петли ST-T во аксиальной плоскости: {"{:.3e}".format(area_projections[2])}')
if input_data["count_qrst_angle"]:
message.append(f'Пространственный угол QRST равен {round(angle_qrst, 2)} градусов')
# Проверка на факт наличия дополнительных ошибок (для разработчика)
if isinstance(res, str) and config["dev_mode"] and res not in ['no_this_period', 'too_noisy']:
st.error(res)
# Вывести результаты
if not error:
if message != []:
for text in message:
if 'Здоров' in text:
st.markdown(f'#### :green[{text}]')
elif 'Болен' in text:
st.markdown(f'#### :red[{text}]')
else:
st.markdown(f'##### {text}')
if charts != []:
for chart in charts:
st.plotly_chart(chart, use_container_width=True)
else:
st.warning("Пожалуйста, загрузите файл .edf для обработки.")
if __name__ == "__main__":
# Загрузка конфигурации программы:
with open('configs/config.json', 'r', encoding='utf-8') as json_file:
config = json.load(json_file)
main(config)