-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathscript.sh
36 lines (36 loc) · 1.05 KB
/
script.sh
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
#!/bin/bash
i="0"
while [$i<3]
do
if [$i==0] $prot=1TIM
if [$i==1] $prot=1SGV
if [$i==2] $prot=1EGD
cd /home/usuari/Escriptori
mkdir Estructures
cd Estructures
wget http://ftp.rcsb.org/download/$$prot.pdb
wget http://ftp.rcsb.org/download/$$prot.pdb
wget http://ftp.rcsb.org/download/$$prot.pdb
echo nombre de subunitats: >>$prot.txt
more $prot.pdb|egrep '^COMPND .+ CHAIN:'>>$prot.txt
clear
echo Nombre de subunitats: FET
read -p "Prem intro..."
echo Proteïna cristal.litzada: >>$prot.txt
more $prot.pdb|egrep 'CRYSTALLOGRAPHY'>>$prot.txt
echo Proteïna cristal.litzada: FET
read -p "Prem intro..."
echo Organisme de procedència: >>$prot.txt
more $prot.pdb|egrep -i '^source .+ organism_SCIENTIFIC: '>>$prot.txt
echo Organisme de procedència: FET
read -p "Prem intro..."
echo Resolució de lestructura>> $prot.txt
more $prot.pdb|egrep 'RESOLUTION\.'>>$prot.txt
echo Resolució de lestructura: FET
read -p "Prem intro..."
echo Codi enzimàtic: >>$prot.txt
more $prot.pdb|egrep '^COMPND .+ EC'>>$prot.txt
echo Codi enzimàtic: FET
read -p "Prem intro..."
i=$[$i+1]
done