Rを使った統計モデリングに関する各種情報をまとめます
- StanをRに実装したもの。 http://qiita.com/uri/items/2fd051c18a148f7d2a35 に記事を書いたの参考
モデルを記述する.rstanという拡張子のファイルとstan実行のための.Rファイルを用意する（必ずそうしなければいけないというわけでなく、Rファイル単体にモデルを記述することもできるが、メンテナンスなどの理由から個別のファイルにすることを勧める）。
https://github.com/stan-dev/rstan/wiki/RStan-Getting-Started にある8schools.stanとrats.stanを見てみましょう。.stanファイルは次のような構造を持っていることがわかります
- data
- parameters
- transformed parameters
- model
- generated quantities
手続き型と呼ばれます。
library(rstan)
model <- stan_model() # モデルファイルの読み込み
公式ページに各種ドキュメントがあるのでどうぞ