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Copy pathpres_psi(sp p int)p(sp p int_o p int_d p sp t int_o),psiba.out
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pres_psi(sp p int)p(sp p int_o p int_d p sp t int_o),psiba.out
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PRESENCE - Presence/Absence-Site Occupancy data analysis
Thu Jun 01 23:39:16 2017, Version 12.0_170523.
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==>i=paodata.pao
==>j=.\pres62c521c4cf0.dm
==>l=pres_psi(sp p int)p(sp p int_o p int_d p sp t int_o),psiba.out
==>
==>quiet
==>maxfn=32000
==>name=psi(SP + INT)p(SP + INT_o + INT_d + SP:INT_o),psiBA
varcov: nsig=6 eps=1.000000e-002
no model name N,T-->148,3
********* Input Data summary *******
Number of sites = 148
Number of sampling occasions = 3
Number of states = 0
Number of missing observations = 229
Data checksum = 44097
NSiteCovs-->9
site_covname[0]=Int_psiA
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NSampCovs-->25
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samp_covname[4]=SP2:INT_o2_pA
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samp_covname[6]=SP2_pB
samp_covname[7]=INT_o2_pB
samp_covname[8]=INT_d2_pB
samp_covname[9]=SP2:INT_o2_pB
samp_covname[10]=Int_rA
samp_covname[11]=SP2_rA
samp_covname[12]=INT_o2_rA
samp_covname[13]=INT_d2_rA
samp_covname[14]=SP2:INT_o2_rA
samp_covname[15]=Int_rBA
samp_covname[16]=SP2_rBA
samp_covname[17]=INT_o2_rBA
samp_covname[18]=INT_d2_rBA
samp_covname[19]=SP2:INT_o2_rBA
samp_covname[20]=Int_rBa
samp_covname[21]=SP2_rBa
samp_covname[22]=INT_o2_rBa
samp_covname[23]=INT_d2_rBa
samp_covname[24]=SP2:INT_o2_rBa
Primary periods=1 Secondary periods: 3
Naive occupancy estimate = 1.0000
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
two sp essaie
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
N=148 T=3 Groups=1 bootstraps=0
-->unit 74_B
Matrix 1: rows=4, cols=4
-,a1,a2,a3
psiA Int_psiA SP2_psiA INT2_psiA
psiBA Int_psiBA SP2_psiBA INT2_psiBA
psiBa Int_psiBa SP2_psiBa INT2_psiBa
========================
Matrix 2: rows=16, cols=6
-,b1,b2,b3,b4,b5
pA[1] Int_pA SP2_pA INT_o2_pA INT_d2_pA SP2:INT_o2_pA
pA[2] Int_pA SP2_pA INT_o2_pA INT_d2_pA SP2:INT_o2_pA
pA[3] Int_pA SP2_pA INT_o2_pA INT_d2_pA SP2:INT_o2_pA
pB[1] Int_pB SP2_pB INT_o2_pB INT_d2_pB SP2:INT_o2_pB
pB[2] Int_pB SP2_pB INT_o2_pB INT_d2_pB SP2:INT_o2_pB
pB[3] Int_pB SP2_pB INT_o2_pB INT_d2_pB SP2:INT_o2_pB
rA[1] Int_rA SP2_rA INT_o2_rA INT_d2_rA SP2:INT_o2_rA
rA[2] Int_rA SP2_rA INT_o2_rA INT_d2_rA SP2:INT_o2_rA
rA[3] Int_rA SP2_rA INT_o2_rA INT_d2_rA SP2:INT_o2_rA
rBA[1] Int_rBA SP2_rBA INT_o2_rBA INT_d2_rBA SP2:INT_o2_rBA
rBA[2] Int_rBA SP2_rBA INT_o2_rBA INT_d2_rBA SP2:INT_o2_rBA
rBA[3] Int_rBA SP2_rBA INT_o2_rBA INT_d2_rBA SP2:INT_o2_rBA
rBa[1] Int_rBa SP2_rBa INT_o2_rBa INT_d2_rBa SP2:INT_o2_rBa
rBa[2] Int_rBa SP2_rBa INT_o2_rBa INT_d2_rBa SP2:INT_o2_rBa
rBa[3] Int_rBa SP2_rBa INT_o2_rBa INT_d2_rBa SP2:INT_o2_rBa
========================
Matrix 3: rows=0, cols=0
========================
Matrix 4: rows=0, cols=0
========================
Matrix 5: rows=0, cols=0
========================
Matrix 6: rows=0, cols=0
========================
modtype=3
Two Species, Single Season Model:
---------------------------------
-- alternate parameterization requested: psiA,psiBA,psiBa,pA,pB,rA,rBA,rBa
-- stacked input: 1st 74 records=species A, last 74 records=species B
Model:psi(SP + INT)p(SP + INT_o + INT_d + SP:INT_o),psiBA flags:(0 0 0 0) (ind-occ det-eq det-ind init)
NPar=8 s=unit 74_B
Number of parameters = 8
Number of function calls = 530
**** Numerical convergence may not have been reached.
Parameter estimates converged to approximately
2.03 significant digits.
-2log(likelihood) = 248.5803
AIC = 264.5803
Untransformed Estimates of coefficients for covariates (Beta's)
======================================================================
estimate std.error
A1 psiA.Int_psiA : 119.261673 10.000000
A2 psiA.SP2_psiA : -65.079219 10.000000
A3 psiA.INT2_psiA : 0.000000 10.000000
B1 pA[1].Int_pA : -5.887767 4.334373
B2 pA[1].SP2_pA : -0.106447 56.699984
B3 pA[1].INT_o2_pA : 5.548551 4.334414
B4 pA[1].INT_d2_pA : -3.724597 1.047325
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psiBA 139 unit 65_B : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psiBA 140 unit 66_B : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
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psiBA 142 unit 68_B : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
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psiBA 145 unit 71_B : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
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psiBA 147 unit 73_B : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psiBA 148 unit 74_B : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
Individual Site estimates of <psiBa>
Site estimate Std.err 95% conf. interval
psiBa 1 unit 1_A : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psiBa 2 unit 2_A : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
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psiBa 4 unit 4_A : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
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psiBa 6 unit 6_A : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
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psiBa 8 unit 8_A : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psiBa 9 unit 9_A : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psiBa 10 unit 10_A : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
psiBa 11 unit 11_A : 1.0000 0.0000 1.0000 - 1.0000
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Individual Site estimates of <pA[1]>
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