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PyMOL de Código Aberto para Windows

O PyMOL de código aberto está disponível gratuitamente. Uma versão pré-compilada de código aberto do PyMOL está disponível gratuitamente em Christoph Gohlke do Departamento de Engenharia Biomédica, Universidade da Califórnia, Irvine.

Este repositório fornece um método para instalar o PyMOL v2.6 no Windows. Se necessário, uma versão em inglês deste guia está disponível aqui.

Download e Instalação

Siga estes passos para instalar o PyMOL v2.6:

  1. Instale a versão mais recente do Python (v3.12.x) para Windows a partir aqui.

Observação: Certifique-se de que a opção para adicionar variáveis de ambiente esteja selecionada ou adicione a pasta do python.exe ao PATH do sistema.

  1. Instale os pacotes Python necessários
python -m pip install numpy
python -m pip install pmw
python -m pip install pyqt5
  1. Baixe arquivos "wheel" de PyMOL de código aberto pré-compilados, compatíveis com Python 3.12 e Windows 64-bit, pelos links abaixo:

Observação : Você pode verificar a versão do Python no anaconda digitando python --version.

Se você estiver usando uma versão diferente do Python ou Windows 32-bits, existem outras versões pré-compiladas aqui.

A estrutura do nome do arquivo é a seguinte:

pymol‑2.6.0a0‑cp312‑cp312‑win_amd64.whl
         \         \          \
          \         \          \___ para 64 bits do Windows
           \         \
            \         \____________ para Python 3.12.x
             \
              \____________________ versão PyMOL 2.6.0a0
  1. Instale os arquivos "wheel"

Na janela do CMD (não do PowerShell!), mude para o diretório de download (C:\Usuários\<Seu Nome de Usuário>\Downloads):

cd Downloads

Em seguida, instale pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whl digitando:

python -m pip install --no-index --find-links="%CD%" pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whl

Por fim, para instalar pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whl, execute:

python -m pip install --upgrade --no-deps pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whl

Observação: Se você baixou arquivos diferentes no Passo 4, substitua pymol_launcher-2.6-cp312-cp312-win_amd64.whl e pymol-2.6.0a0-cp312-cp312-win_amd64.whl pelos arquivos wheel baixados.

  1. Inicie o PyMOL v2.6

No prompt de comando (não no PowerShell!), execute:

where.exe pymol
pymol

Então, o PyMOL v2.6 será iniciado e pronto para uso.

  1. (Opcional) Criar um atalho para o PyMOL
where.exe pymol

A localização do PyMOL.exe será exibida. Vá até a localização do arquivo, clique com o botão direito em PyMOL.exe e copie-o para sua Área de Trabalho.