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models
├── BERT
│ └── scibert_scivocab_uncased
│ ├── bert_config.json
│ ├── config.json
│ ├── pytorch_model.bin
│ ├── vocab.txt
│ └── weights.tar.gz
├── Classifiers
│ ├── softmax.cui.h5
│ ├── softmax.cui.map
│ ├── softmax.sty.h5
│ └── softmax.sty.map
├── ContextualNER
│ └── mm_st21pv_SCIBERT_uncased
│ ├── best.th
│ ├── config.json
│ ├── metrics.json
│ ├── stderr.log
│ ├── stdout.log
│ └── vocabulary
│ ├── labels.txt
│ ├── non_padded_namespaces.txt
│ └── token_characters.txt
├── ExactMatchNER
│ └── umls.2017AA.active.st21pv.nerfed_nlp_and_matcher.max3.p
├── SimString
│ ├── umls.2017AA.active.full.aliases.3gram.5toks.db
│ ├── umls.2017AA.active.full.aliases.5toks.map
│ ├── umls.2017AA.active.st21pv.aliases.3gram.5toks.db
│ └── umls.2017AA.active.st21pv.aliases.5toks.map
├── Validators
│ ├── mm_st21pv.lr_clf_cui.dev.joblib
│ ├── mm_st21pv.lr_clf_cui.train2.joblib
│ ├── mm_st21pv.lr_clf_cui.train.joblib
│ ├── mm_st21pv.lr_clf_sty.dev.joblib
│ ├── mm_st21pv.lr_clf_sty.train2.joblib
│ └── mm_st21pv.lr_clf_sty.train.joblib
└── VSMs
├── mm_st21pv.cuis.scibert_scivocab_uncased.vecs
├── mm_st21pv.sts_anns.scibert_scivocab_uncased.vecs
└── mm_st21pv.sts_cpts.scibert_scivocab_uncased.vecs
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