From ccada17d5ce8db3df43accecba6e8e04877a87d7 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: MTMTM <38204311+MTMTM@users.noreply.github.com> Date: Thu, 27 Jun 2024 15:44:09 +0900 Subject: [PATCH] Create 2024-06-27-post4.md --- _posts/ja/2024-06-27-post4.md | 17 +++++++++++++++++ 1 file changed, 17 insertions(+) create mode 100644 _posts/ja/2024-06-27-post4.md diff --git a/_posts/ja/2024-06-27-post4.md b/_posts/ja/2024-06-27-post4.md new file mode 100644 index 00000000..99358c67 --- /dev/null +++ b/_posts/ja/2024-06-27-post4.md @@ -0,0 +1,17 @@ +--- +layout: post +published: true +title: '「TogoVar」のデータアップデートのお知らせ' +tags: + - public_relations + - services +category: ja +--- + +ヒトゲノムバリアントの統合データベース「TogoVar」[https://togovar.org/](https://togovar.org/)では、機能追加、データ拡充を継続的に実施しています。この度、以下のようにデータをアップデートしましたので、お知らせします。
+ +- [理化学研究所](https://www.ims.riken.jp/)が解析した[バイオバンクジャパン](https://biobankjp.org/)第一コホート47疾患のSNPアレイにより決定されたゲノム情報のうち、[45疾患](https://grch38.togovar.org/doc/ja/datasets/jga_snp#diseases_jgad000123)のアレル頻度およびgenotype count（疾患別ならびに男女別）を、疾患ごとの情報として[JGA-SNP](https://grch38.togovar.org/doc/ja/datasets/jga_snp) に追加しました。理化学研究所が解析したgenotypingデータは、NBDCヒトデータベースの[JGAS000114 / JGAD000123](https://humandbs.dbcls.jp/hum0014-latest)として登録されています。 + +- [ナショナルセンター・バイオバンクネットワーク(NCBN)](https://ncbiobank.org/)がサンプルの収集と全ゲノム解析を実施した9,290人の日本人のアレル頻度およびgenotype countを[NCBNデータセット](https://grch38.togovar.org/doc/ja/datasets/ncbn)として新たに追加しました（GRCh38のみ）。同頻度データはNBDCヒトデータベースのhum0331.v1.freq.v1として登録され[当該データのページ](https://humandbs.dbcls.jp/hum0331-v1#hum0331.v1.freq.v1)からダウンロードできます。 + +詳細は、TogoVarウェブサイトの[History（更新履歴）](https://grch38.togovar.org/doc/ja/history) をご覧ください。