- §54：經教育部評鑑優良的大學，可和國外「優質」大學合作，共同設立分校、學院或開設學位專班，且主管產生方式、教師聘用、學費收入、學位頒授程序、採購不受大學法等法規限制
- §55之1、之2：與大學合作設立的外國大學分校、學院，關於教師聘任辦法除原教師法規範，還可以在依外國母校的狀況和需求另行訂立規則
- §55之3、之4：該外國大學分校、學院的設立、組織和運作辦法、校長遴選等事項，不受現行的私立學校法、大學法、教育人員任用條例等相關規則規範
- §55之5、之6、之7：該外國大學分校、學院所需要的研究教學必需品，可以免徵關稅和營業稅，學校的不動產經地方政府同意後，也可免徵房屋稅、地價稅等稅金
- §56：國立大學和外國大學合作設立的教育單位，行政主管可採「契約」方式彈性聘雇。另外，其涉及使用的公有不動產，可不受國有財產法規定，以出租或設定地上權方式使用
- §57：對於大學是否有申請合作辦學的資格、設立學校或學院後的管理、招生、聘用教職員等辦法，由教育部擬定
在自經區特別條例中，國內外大學合作設立的分校，學校的不動產經縣/市政府同意後，可免徵房屋稅、地價稅等稅金。另外，國立大學和外國大學合作設立的教育單位，其涉及使用的公有不動產，可不受國有財產法規定，以出租或設定地上權方式使用。
透過設立分校的方式，外國學校可以進行產學合作的各種創新事業，從蓋工廠到建醫院，從興辦實習旅館、餐廳、福利照護、健康中心等事業，都可以教育創新之名，在自經區取得各項賦稅優惠。
如何監督私校不濫用稅賦機制來興業，不藉著土地稅金鬆綁、國有土地使用規則鬆綁，以「假設立教學實習機構（教學飯店、醫院），真炒地皮」，目前教育部仍未訂出相關規範機制。