.gitignore

##########################
# Orfmap data            #
##########################


examples/tests

orfmap-*/orfmap/*
!orfmap-*/orfmap/data/

orfmap-*/orfmap/data/*
!orfmap-*/orfmap/data/scerevisiae/

# Byte-compiled / optimized / DLL files
__pycache__/
*.py[cod]

##########################
# Python compiled source #
##########################
*\.pyc
*\.pyo
build/
dist/
doc/_build/

orfmap/__pycache__/
**/lib/__pycache__/

**egg-*
**/*egg-*

examples/tests
#################
# pycharm files #
#################
**.idea/

#################
# python virtual envs#
#################
**.env
**env
**.venv
**venv


##############################
# ORFold softwares directory #
##############################
orfold_v1/orfold/softwares/

##############################
# others 
##############################
**.idea
**docs/*._*
**docs/*/*._*
**docs/*/*/._*

**.sif
**.bak

site/
**.DS_Store
**.idea

# ./packages