ข้อ 8 การเตือน cluster โรคในคน (ฝั่ง server side)

[pphetra]

เป็นการเขียนเงื่อนไขโปรแกรม เพื่อแจ้งเป็นรายงาน Cluster โรคในคน

แนวทาง

• ต้องมีการสร้างประเภทรายงานแจ้งเตือน
• ต้อง research ใช้ CEP ได้หรือไม่ (ขึ้นกับนิยามพื้นที่เดียวกันด้วย)

คำถาม

• นิยามคำว่า "ในสถานที่เดียวกัน" คืออะไร เช่น อปท.เดียวกัน หรือ พิกัดที่ share location ถ้าพิกัดที่ share location รัศมีกี่กิโล จึงจะนับเป็นสถานที่เดียวกัน

[pphetra]

create report type

name: แจ้งเตือน cluster โรคในคน
code: human_disease_cluster_warning
category: คน
authority: สาธารณสุข
form definition:

• symptomGroup (กลุ่มอาการ)
  Django template:
• พบผู้ป่วย 2 รายขึ้นไปใน 1 สัปดาห์ในสถานที่เดียวกัน มีอาการตามกลุ่มอาการ {{ symptom_group }}
  summary template:

{
    "id": { "field": "pk", "weight": 100}, 
    "สถานะ": { "field": "stateName", "weight": 60}, 
    "วันที่": { "field": "date", "weight": 40}, 
    "พื้นที่": { "field": "area", "weight": 30},  
    "ประเภทรายงาน": { "field": "typeName", "weight": 29}, 
    "กลุ่มอาการ": {"field": "formData.symptomGroup", "weight": 10}
}   

is_system: true
followable: no
notification_type "based on admin_area"

[pphetra]

deleted

[pphetra]

เนื่องจากการ clustering จะต้องใช้ package sklearn ซึ่งมีเฉพาะ python3 ดังนั้น ตัว app จะทำเป็น standalone app ที่คอย periodic scan reports เมื่อพบว่ามี cluster ก็จะทำการยิง api เข้ามาที่ podd-api

app ใหม่ -> https://github.com/openpodd/pond-human-cluster

ทางเข้าที่มีอยู่แล้ว

note: ทางเข้านี้มีปัญหาที่ จะสร้างได้เฉพาะ report type ชนิดเดียวกันกับที่ related เท่านั้น
endpoint

report/protect-create-with-state/(?P<key>[.\w-]+)/(?P<state>[\w-]+)/(?P<case>[\w-]+)/

parameter ที่สำคัญคือ

• related_ids เป็น array ของ report ที่อยู่ใน cluster

solution

ให้ทำทางเข้าใหม่ ที่เลียนแบบทางเข้าเดิม แต่เพิ่มให้สร้างระบุ report_type เข้ามาด้วย

[rachumala]

@pphetra [รับจากคุณน้อย 5 มค 67] คุณน้อยสอบถามหมอบิวมาให้เพิ่มเติม ดังนี้

[pphetra]

e1a2e5102ef5545c3b81c85303045f5302eeb1d5

ปัญหาที่เจอคือไม่สามารถ related report ได้ เพราะโครงสร้างการ link report ของเก่ามันเป็นทิศทางเดียว กรณีนี้เป็นการ link กลับด้านกัน

[rachumala]

19 มค 67

1. เพิ่ม report type ที่ api ของ admin-demo [note : ถ้าไม่มีอะไรแก้ จึงจะ config report type ที่ api ของ admin-template]

2. ใช้ podd line report รายงาน โรคในคน @pphetra

note : เมื่อมีการรายงานโรคในคนที่เข้าข่าย cluster แล้ว นับถัดไปอีก 2 วัน ระบบจะทำรายงานการแจ้งเตือนขึ้นที่ dashboard เช่น
มีการรายงานวันที่ 2 กพ 67 หลังจากนั้นวันที่ 4 กพ 67 จะมีรายงานแจ้งเตือน ตย.ดังรูป

[pphetra]

image อยู่ที่ https://hub.docker.com/repository/docker/pphetra/podd-human-cluster/general

docker build --platform linux/amd64  -t 'pphetra/podd-human-cluster:1.0' .
docker push pphetra/podd-human-cluster:1.0

[pphetra]

docker image จะถูก build โดย GitHub action และ push เข้า docker hub
ตัว docker container run อยู่ที่เครื่อง analytic ใหม่

CONTAINER ID   IMAGE                            COMMAND                  CREATED        STATUS                    PORTS                    NAMES
27cee336816d   pphetra/podd-human-cluster:1.0   "sh /app/entrypoint.…"   6 days ago     Up 6 days                 80/tcp                   dreamy_chandrasekhar
e0dccb189a68   apache/superset:2.1.0            "/app/docker/docker-…"   4 months ago   Up 4 months               8088/tcp                 superset_worker_beat
ceee5497eb38   apache/superset:2.1.0            "/app/docker/docker-…"   4 months ago   Up 4 months (healthy)     0.0.0.0:8088->8088/tcp   superset_app
4d0f6765b127   apache/superset:2.1.0            "/app/docker/docker-…"   4 months ago   Up 4 months (unhealthy)   8088/tcp                 superset_worker
d533ecf6029e   redis:7                          "docker-entrypoint.s…"   4 months ago   Up 4 months               6379/tcp                 superset_cache

[rachumala]

1 กพ 67 >> ที่ admin-demo มีการเปลี่ยน config. ที่ Django template

ปรับแก้ config. Django template ที่ api ของ admin-template ตาม admin-demo

[rachumala]

1 มีค 67 @pphetra คุณน้อยสอบถามเพิ่มเติม พิกัด ในตัวรายงาน cluster อันนี้อ้างอิง พิกัด อย่างไรครับ ตาม อปท. หรือ พิกัดของรายงานครับ

พี่ป๊อกแจ้ง ตัว cluster เราไม่ได้ส่งพิกัดเข้าไป พิกัดที่เห็นน่าจะเป็น default ที่แสดงขึ้นมาโดย คิดว่ามาจาก administrationarea_id

จิ๋ว แจ้ง คุณน้อย ตามที่พี่ป๊อกแจ้ง