https://biosciencedbc.jp/event/ajacs/ajacs2024-07-25-MAG.html
データ解析講習会:AJACS(あじゃっくす)は、生命科学におけるデータ解析の入り口を提供する講習会です。
2024年7月25日(木)13:30~15:50
オンライン
- 13:30~13:40 NBDCの紹介
- 箕輪 真理(NBDC)
- 13:40~14:40 メタゲノムとMAG解析について
- 森 宙史氏 (国立遺伝学研究所)
- 微生物群集の系統組成や遺伝子機能組成を解析する手法としてメタゲノム解析は広く用いられている。本講義ではメタゲノム解析の概要と最近の解析のトレンドである、メタゲノム配列から個々の細菌のゲノム配列(Metagenome Assembled Genome:MAG)を再構築するMAG解析技術について解説する。現状のMAG解析技術の利点と問題点を知ることでメタゲノムデータや論文を適切に解釈できるようになる。
- 森 宙史氏 (国立遺伝学研究所)
- 14:50~15:50 メタゲノム・MAGデータを検索する
- 森 宙史氏 (国立遺伝学研究所)
- メタゲノム配列データおよびMAG配列データは公共の塩基配列レポジトリおよび様々なデータベース中に存在し自由に利用することが可能である。本講義ではINSDCのデータベースやMGnify、Microbiome Datahubなど、代表的なメタゲノムおよびMAGのデータベースにおけるデータの検索や利用方法について解説する。本講義を受けることで目的に応じて既存のメタゲノムデータやMAGデータを探索し再利用することが可能になる。
- 森 宙史氏 (国立遺伝学研究所)