AJACS103-2024-12-23

データ解析講習会：
AJACS「シングルセルRNA-seqを知って・学んで・使う」

NBDC事業推進室 公式ウェブページ

https://biosciencedbc.jp/event/ajacs/ajacs2024-12-23-scRNA-seq.html

開催概要

データ解析講習会：AJACS（あじゃっくす）は、生命科学におけるデータ解析の入り口を提供する講習会です。

日時

2024年12月23日（月）13:30～15:50

開催方法

オンライン

プログラム

• 13:30～13:40 NBDCの紹介
• 13:40～14:20 scRNA-seqデータを用いた細胞分類入門
  • 飯田 渓太氏 (大阪大学)
    • シングルセルRNAシークエンス(scRNA-seq)データを用いた細胞分類の手法の多くは、遺伝子発現量を用いた統計的クラスタリングと文献調査にもとづく遺伝子の機能アノテーションによっている。本講演では、scRNA-seq解析のやさしい導入と、革新的ツールについて紹介する。
• 14:30～15:10 遺伝子発現解析だけではない！シングルセルデータを活かしきろう
  • 小口 綾貴子氏 (理化学研究所)
    • 5′ シングルセルデータを用いることで、遺伝子発現解析だけでなく、プロモーターやエンハンサーの転写開始点解析が可能である。本講演ではそのノウハウをお伝えする。
• 15:20～15:50 公共データベースからシングルセルRNA-seqデータを取得する
  • 粕川 雄也氏 (理化学研究所)
    • シングルセルRNA-seq法は広く使われるようになったことで、実際に実験しなくても公共リポジトリやデータベースから入手できるようになってきた。こうした現状と公共データベースの活用方法について理解する。