生物软件设计开发

最近更新了后缀数组O(n)，不需要轮转矩阵O(n^2)的空间，大大的节省了空间复杂度

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BWT算法

二阶BWT算法

结合hash的分段BWT算法的模糊匹配

保存索引

二阶优化

均匀分段

临近的结果？

Name		Name	Last commit message	Last commit date
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doc		doc
.gitattributes		.gitattributes
.gitignore		.gitignore
BWT.cpp		BWT.cpp
BWT.h		BWT.h
BWT2.cpp		BWT2.cpp
BWT2.h		BWT2.h
ClassDiagram.cd		ClassDiagram.cd
Hash_BWT.cpp		Hash_BWT.cpp
Hash_BWT.h		Hash_BWT.h
README.md		README.md
biosoft-dev2.cpp		biosoft-dev2.cpp
biosoft-dev2.vcxproj		biosoft-dev2.vcxproj
biosoft-dev2.vcxproj.filters		biosoft-dev2.vcxproj.filters
resource.h		resource.h
stdafx.cpp		stdafx.cpp
stdafx.h		stdafx.h
sub.fa		sub.fa
targetver.h		targetver.h
test.fa		test.fa