MAINT: use --ignore instead of --re-ignore where possible

tox.ini

@@ -81,22 +81,22 @@ allowlist_externals =
 commands =
   sphinx-autobuild \
     --builder=dirhtml \
+    --ignore=docs/_build/ \
+    --ignore=docs/api/ \
+    --ignore=docs/usage/logs/ \
     --open-browser \
     --re-ignore='.*/__pycache__/.*' \
     --re-ignore='.*/.ipynb_checkpoints/.*' \
-    --re-ignore='docs/_build/.*' \
-    --re-ignore='docs/.*\.csv' \
-    --re-ignore='docs/.*\.gif' \
-    --re-ignore='docs/.*\.gv' \
-    --re-ignore='docs/.*\.inv' \
-    --re-ignore='docs/.*\.json' \
-    --re-ignore='docs/.*\.pickle' \
-    --re-ignore='docs/.*\.png' \
-    --re-ignore='docs/.*\.svg' \
-    --re-ignore='docs/.*\.yaml' \
-    --re-ignore='docs/.*\.yml' \
-    --re-ignore='docs/api/.*' \
-    --re-ignore='docs/usage/logs/.*' \
+    --re-ignore='.*/.virtual_documents/.*' \
+    --re-ignore='.*\.csv' \
+    --re-ignore='.*\.gif' \
+    --re-ignore='.*\.gv' \
+    --re-ignore='.*\.inv' \
+    --re-ignore='.*\.json' \
+    --re-ignore='.*\.pickle' \
+    --re-ignore='.*\.png' \
+    --re-ignore='.*\.svg' \
+    --re-ignore='.*\.ya?ml' \
     --re-ignore='docs/usage/sub_expr_f?' \
     --watch=docs \
     --watch=src \