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Evinse for Ruby #1557

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Jan 14, 2025
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Evinse for Ruby #1557

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Jan 14, 2025

Conversation

prabhu
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Collaborator

@prabhu prabhu commented Jan 14, 2025

Dude, don't just give me a list of components. Tell me where and how they are used and what services exist or GTFO.

bionomia bom.evinse.json

╔════════════════════════════════╤════════════════════════════════╤═══════════════════════════╤══════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════╗
║ Group                          │ Name                           │                   Version │ Occurrences                                                                      ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ active_record_union            │                     1.3.0 │ models/initialize.rb#35                                                          ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ rails-dom-testing              │                     2.2.0 │ models/initialize.rb#35                                                          ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ securerandom                   │                     0.4.1 │ routes/profile_route.rb#141                                                      ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ biodiversity                   │                     6.0.1 │ lib/frictionless/frictionless_generator.rb#138                                   ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_article.rb#55                                ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_attribution.rb#82                            ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_citation.rb#55                               ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_missing_attribution.rb#89                    ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_not_them.rb#133                              ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_occurrence.rb#60                             ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_problem_collector.rb#84                      ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_problem_determiner.rb#81                     ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_unresolved_user.rb#87                        ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_user.rb#75                                   ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#38                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#47                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#57                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#66                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#76                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#86                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#97                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#107                                                                    ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#118                                                                    ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#136                                                                    ║
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║                                │                                │                           │ lib/io.rb#160                                                                    ║
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╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ csv                            │                     3.3.2 │ lib/frictionless/frictionless_generator.rb#138                                   ║
║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_article.rb#55                                ║
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║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_not_them.rb#133                              ║
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║                                │                                │                           │ lib/frictionless/frictionless_table_unresolved_user.rb#87                        ║
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║                                │                                │                           │ lib/io.rb#38                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#47                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#57                                                                     ║
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║                                │                                │                           │ lib/io.rb#76                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#86                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#97                                                                     ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#107                                                                    ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#118                                                                    ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#136                                                                    ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#147                                                                    ║
║                                │                                │                           │ lib/io.rb#160                                                                    ║
║                                │                                │                           │ routes/taxon_route.rb#73                                                         ║
║                                │                                │                           │ routes/taxon_route.rb#101                                                        ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ down                           │                     5.4.2 │ lib/zenodo/zenodo.rb#100                                                         ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#102                                                         ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ dwc_agent                      │                   3.3.0.0 │ lib/authorities/wikidata_search.rb#35                                            ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ namae                          │                     1.2.0 │ lib/authorities/wikidata_search.rb#35                                            ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ elasticsearch                  │                   7.17.11 │ lib/elastic/elastic_indexer.rb#151                                               ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#100                                                         ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#102                                                         ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ elasticsearch-transport        │                   7.17.11 │ lib/zenodo/zenodo.rb#100                                                         ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#102                                                         ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ faraday                        │                    2.12.2 │ lib/zenodo/zenodo.rb#100                                                         ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#102                                                         ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ oauth2                         │                     2.0.9 │ lib/zenodo/zenodo.rb#31                                                          ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#100                                                         ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#102                                                         ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ oj                             │                    3.16.9 │ lib/io.rb#189                                                                    ║
║                                │                                │                           │ lib/network.rb#42                                                                ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ omniauth-oauth2                │                     1.8.0 │ environment.rb#95                                                                ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#31                                                          ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#100                                                         ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#102                                                         ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ omniauth-orcid                 │                     2.1.1 │ environment.rb#95                                                                ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#31                                                          ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#100                                                         ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#102                                                         ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ rest-client                    │                     2.1.0 │ lib/zenodo/zenodo.rb#100                                                         ║
║                                │                                │                           │ lib/zenodo/zenodo.rb#102                                                         ║
╟────────────────────────────────┼────────────────────────────────┼───────────────────────────┼──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╢
║                                │ sinatra                        │                     4.1.1 │ models/query_cache.rb#18                                                         ║
╚════════════════════════════════╧════════════════════════════════╧═══════════════════════════╧══════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════╝
╔═════════════════════════════════════════════════════════════╗
║                Component Call Stack Evidence                ║
║                 Generated with ♥  by cdxgen                 ║
╟───────┬────────────────┬─────────┬──────────────────────────╢
║ Group │ Name           │ Version │ Call Stack               ║
╟───────┼────────────────┼─────────┼──────────────────────────╢
║       │ csv            │ 3.3.2   │ routes/taxon_route.rb#73 ║
╟───────┼────────────────┼─────────┼──────────────────────────╢
║       │ pagy           │ 9.3.3   │ application.rb           ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#6    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#7    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#8    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#9    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#10   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#11   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#12   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#13   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#14   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#15   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#16   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#18   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#19   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#20   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#21   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#22   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#23   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#25   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#35   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#38   ║
║       │                │         │ └──  application.rb#39   ║
╟───────┼────────────────┼─────────┼──────────────────────────╢
║       │ sinatra        │ 4.1.1   │ application.rb           ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#6    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#7    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#8    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#9    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#10   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#11   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#12   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#13   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#14   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#15   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#16   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#18   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#19   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#20   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#21   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#22   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#23   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#25   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#35   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#38   ║
║       │                │         │ └──  application.rb#39   ║
╟───────┼────────────────┼─────────┼──────────────────────────╢
║       │ sinatra-cacher │ 1.0.0   │ application.rb           ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#6    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#7    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#8    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#9    ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#10   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#11   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#12   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#13   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#14   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#15   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#16   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#18   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#19   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#20   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#21   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#22   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#23   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#25   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#35   ║
║       │                │         │ ├──  application.rb#38   ║
║       │                │         │ └──  application.rb#39   ║
╚═══════╧════════════════╧═════════╧══════════════════════════╝

╔════════════════════════════════════════════════╗
║              Reachable Components              ║
║          Generated with ♥  by cdxgen           ║
╟──────────────────────────────┬─────────────────╢
║ Package URL                  │ Reachable Flows ║
╟──────────────────────────────┼─────────────────╢
║ pkg:gem/[email protected]        │ 20              ║
╟──────────────────────────────┼─────────────────╢
║ pkg:gem/[email protected] │ 18              ║
╟──────────────────────────────┼─────────────────╢
║ pkg:gem/[email protected]            │ 4               ║
╟──────────────────────────────┼─────────────────╢
║ pkg:gem/[email protected]           │ 1               ║
╚══════════════════════════════╧═════════════════╝

╔═════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════════╗
║                                                              List of Services                                                               ║
║                                                         Generated with ♥  by cdxgen                                                         ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┬─────────────────────────────────────────────────┬───────────────┬──────────────────╢
║ Name                                                   │ Endpoints                                       │ Authenticated │ X Trust Boundary ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────┼──────────────────╢
║ bin/bluesky-rb-service                                 │ https://bionomia.net/#{u.identifier}            │               │                  ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────┼──────────────────╢
║ helpers/image_helper-rb-service                        │ https://img.bionomia.net/                       │               │                  ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────┼──────────────────╢
║ helpers/occurrence_helper-rb-service                   │ http://schema.org/                              │               │                  ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────┼──────────────────╢
║ lib/frictionless/frictionless_table_article-rb-service │ https://doi.org/#{a}                            │               │                  ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────┼──────────────────╢
║ lib/io-rb-service                                      │ http://schema.org/                              │               │                  ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────┼──────────────────╢
║ lib/network-rb-service                                 │ http://schema....                               │               │                  ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────┼──────────────────╢
║ models/occurrence-rb-service                           │ https:/...                                      │               │                  ║
║                                                        │ https://gbif.org/occurrence/#{id}               │               │                  ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────┼──────────────────╢
║ models/user-rb-service                                 │ https://orcid.org/#{orcid}                      │               │                  ║
╟────────────────────────────────────────────────────────┼─────────────────────────────────────────────────┼───────────────┼──────────────────╢
║ routes/admin_route-rb-service                          │ /admin                                          │               │                  ║
║                                                        │ /article/:id                                    │               │                  ║
║                                                        │ /datasets                                       │               │                  ║
║                                                        │ /dataset/frictionless.json                      │               │                  ║
║                                                        │ /dataset/refresh.json                           │               │                  ║
║                                                        │ /dataset/:id                                    │               │                  ║
║                                                        │ /datasets/search                                │               │                  ║
║                                                        │ /organizations                                  │               │                  ║
║                                                        │ /organizations/search                           │               │                  ║
║                                                        │                                                 │               │                  ║
║                                                        │ /organizations/duplicates                       │               │                  ║
║                                                        │ /organizations/merge                            │               │                  ║
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║                                                        │ /organization/:id/codes.json                    │               │                  ║
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║                                                        │ /users/destroyed                                │               │                  ║
║                                                        │ /users/destroyed/:id                            │               │                  ║
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║                                                        │ /article/add                                    │               │                  ║
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prabhu added 2 commits January 14, 2025 10:50
@prabhu
Working occurrences evidence
1e73441 
Signed-off-by: Prabhu Subramanian <[email protected]>
@prabhu
Working callstack and services evidence
078ffe5 
Signed-off-by: Prabhu Subramanian <[email protected]>
@prabhu prabhu merged commit 2d6a72b into master Jan 14, 2025
24 checks passed
@prabhu prabhu deleted the feature/ruby-evinse branch January 14, 2025 12:06
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