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Estructura de servicios para la implementacion del proyecto final de AMq2

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Ejemplo de ambiente productivo

AMq2 - CEIA - FIUBA

Estructura de servicios para la implementación del proyecto final de AMq2 - CEIA - FIUBA

Supongamos que trabajamos para ML Models and something more Inc., la cual ofrece un servicio que proporciona modelos mediante una REST API. Internamente, tanto para realizar tareas de DataOps como de MLOps, la empresa cuenta con varios servicios que ayudan a ejecutar las acciones necesarias. También dispone de un Data Lake en S3, para este caso, simularemos un S3 utilizando MinIO.

Para simular esta empresa, utilizaremos Docker y, a través de Docker Compose, desplegaremos varios contenedores que representan distintos servicios en un entorno productivo.

Los servicios que contamos son:

Diagrama de servicios

Por defecto, cuando se inician los multi-contenedores, se crean los siguientes buckets:

  • s3://data
  • s3://mlflow (usada por MLflow para guardar los artefactos).

y las siguientes bases de datos:

  • mlflow_db (usada por MLflow).
  • airflow (usada por Airflow).

Tarea a realizar

La tarea es implementar el modelo que desarrollaron en Aprendizaje de Máquina I en este ambiente productivo. Para ello, pueden usar y crear los buckets y bases de datos que necesiten. Lo mínimo que deben realizar es:

  • Un DAG en Apache Airflow. Puede ser cualquier tarea que se desee realizar, como entrenar el modelo, un proceso ETL, etc.
  • Un experimento en MLflow de búsqueda de hiperparámetros.
  • Servir el modelo implementado en AMq1 en el servicio de RESTAPI.
  • Documentar (comentarios y docstring en scripts, notebooks, y asegurar que la documentación de FastAPI esté de acuerdo al modelo).

Desde ML Models and something more Inc. autorizan a extender los requisitos mínimos. También pueden utilizar nuevos servicios (por ejemplo, una base de datos no relacional, otro orquestador como MetaFlow, un servicio de API mediante NodeJs, etc.).

Ejemplo

El branch example_implementation contiene un ejemplo de aplicación para guiarse. Se trata de una implementación de un modelo de clasificación utilizando los datos de Heart Disease.

Instalación

  1. Para poder levantar todos los servicios, primero instala Docker en tu computadora (o en el servidor que desees usar).

  2. Clona este repositorio.

  3. Crea las carpetas airflow/config, airflow/dags, airflow/logs, airflow/plugins, airflow/logs.

  4. Si estás en Linux o MacOS, en el archivo .env, reemplaza AIRFLOW_UID por el de tu usuario o alguno que consideres oportuno (para encontrar el UID, usa el comando id -u <username>). De lo contrario, Airflow dejará sus carpetas internas como root y no podrás subir DAGs (en airflow/dags) o plugins, etc.

  5. En la carpeta raíz de este repositorio, ejecuta:

docker compose --profile all up
  1. Una vez que todos los servicios estén funcionando (verifica con el comando docker ps -a que todos los servicios estén healthy o revisa en Docker Desktop), podrás acceder a los diferentes servicios mediante:

Si estás usando un servidor externo a tu computadora de trabajo, reemplaza localhost por su IP (puede ser una privada si tu servidor está en tu LAN o una IP pública si no; revisa firewalls u otras reglas que eviten las conexiones).

Todos los puertos u otras configuraciones se pueden modificar en el archivo .env. Se invita a jugar y romper para aprender; siempre puedes volver a clonar este repositorio.

Apagar los servicios

Estos servicios ocupan cierta cantidad de memoria RAM y procesamiento, por lo que cuando no se están utilizando, se recomienda detenerlos. Para hacerlo, ejecuta el siguiente comando:

docker compose --profile all down

Si deseas no solo detenerlos, sino también eliminar toda la infraestructura (liberando espacio en disco), utiliza el siguiente comando:

docker compose down --rmi all --volumes

Nota: Si haces esto, perderás todo en los buckets y bases de datos.

Aspectos específicos de Airflow

Variables de entorno

Airflow ofrece una amplia gama de opciones de configuración. En el archivo docker-compose.yaml, dentro de x-airflow-common, se encuentran variables de entorno que pueden modificarse para ajustar la configuración de Airflow. Pueden añadirse otras variables.

Uso de ejecutores externos

Actualmente, para este caso, Airflow utiliza un ejecutor local, lo que significa que los DAGs se ejecutan en el mismo contenedor. Si desean simular un entorno más complejo, pueden levantar contenedores individuales que actúen como ejecutores utilizando celery, lo que permitirá realizar procesamiento paralelo. Pueden encontrar más información sobre cómo hacerlo aquí. Sin embargo, se decidió no implementarlo en este caso para evitar consumir más recursos.

Uso de la CLI de Airflow

Si necesitan depurar Apache Airflow, pueden utilizar la CLI de Apache Airflow de la siguiente manera:

docker compose --profile all --profile debug down

Una vez que el contenedor esté en funcionamiento, pueden utilizar la CLI de Airflow de la siguiente manera, por ejemplo, para ver la configuración:

docker-compose run airflow-cli config list      

Para obtener más información sobre el comando, pueden consultar aqui.

Variables y Conexiones

Si desean agregar variables para accederlas en los DAGs, pueden hacerlo en secrets/variables.yaml. Para obtener más información, consulten la documentación.

Si desean agregar conexiones en Airflow, pueden hacerlo en secrets/connections.yaml. También es posible agregarlas mediante la interfaz de usuario (UI), pero estas no persistirán si se borra todo. Por otro lado, cualquier conexión guardada en secrets/connections.yaml no aparecerá en la UI, aunque eso no significa que no exista. Consulten la documentación para obtener más información.

Conexión con los buckets

Dado que no estamos utilizando Amazon S3, sino una implementación local de los mismos mediante MinIO, es necesario modificar las variables de entorno para conectar con el servicio de MinIO. Las variables de entorno son las siguientes:

AWS_ACCESS_KEY_ID=minio   
AWS_SECRET_ACCESS_KEY=minio123 
AWS_ENDPOINT_URL_S3=http://localhost:90000

MLflow también tiene una variable de entorno que afecta su conexión a los buckets:

MLFLOW_S3_ENDPOINT_URL=http://localhost:9000

Asegúrate de establecer estas variables de entorno antes de ejecutar tu notebook o scripts en tu máquina o en cualquier otro lugar. Si estás utilizando un servidor externo a tu computadora de trabajo, reemplaza localhost por su dirección IP.

Al hacer esto, podrás utilizar boto3, awswrangler, etc., en Python con estos buckets, o awscli en la consola.

Si tienes acceso a AWS S3, ten mucho cuidado de no reemplazar tus credenciales de AWS. Si usas las variables de entorno, no tendrás problemas.

Pull Request

Este repositorio está abierto para que realicen sus propios Pull Requests y así contribuir a mejorarlo. Si desean realizar alguna modificación, ¡son bienvenidos! También se pueden crear nuevos entornos productivos para aumentar la variedad de implementaciones, idealmente en diferentes branches. Algunas ideas que se me ocurren que podrían implementar son:

  • Reemplazar Airflow y MLflow con Metaflow o Kubeflow.
  • Implementar Airflow con ejecutores de Celery y Flower.
  • Reemplazar MLflow con Seldon-Core.
  • Agregar un servicio de tableros como, por ejemplo, Grafana.

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