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NANDO (Nanbyo Disease Ontology)

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ShinJM/nando

 
 

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NANDO

NANDO(Nanbyo Disease Ontology)は,「指定難病」制度対象の疾患と「小児慢性特定疾病」制度対象の疾患について,国内においてオーソライズされた資料を元に,疾患概念と疾患同士の関係性を厳密に体系化したものである.また,国際的な疾患オントロジーMONDOへのクロスリファレンスを含む.

取得

参照

作成

1. 設定 (Macで検証済み)

  • $ brew install raptor
  • $ pipenv install
  • $ pipenv shell
  • $ ./setting.sh

2. ファイル作成

  1. TTL
    • $ python -m converter
  2. RDF
    • $ rapper -i turtle -o rdfxml-abbrev results/nando.ttl > results/nando.rdf
  3. HTML
    • $ xsltproc --output results/nando.html data/owl2xhtml.xsl results/nando.rdf

統計情報

全疾患 指定難病 小児慢性特定疾病
クラス数 2,347 1,023 1,323
英語表記を含むクラス数 2,284 991 1,292
疾患定義を含むクラス数 1,189 333 856
MONDOへのクロスリファレンスを含むクラス数 1,382 698 684

ライセンス

CC-BY 4.0 | DBCLS

コンタクト

新しい用語のリクエストやクラスの修正依頼,オントロジーに関する問題点・疑問点の報告には,本リポジトリの Issue tracker をご利用ください.

出典

謝辞

  • 本オントロジーの構築に際してDDrareおよびRDVJを参照した.
  • 本オントロジーの構築にBioHackathonの成果を利用した.

About

NANDO (Nanbyo Disease Ontology)

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