NANDO(Nanbyo Disease Ontology)は,「指定難病」制度対象の疾患と「小児慢性特定疾病」制度対象の疾患について,国内においてオーソライズされた資料を元に,疾患概念と疾患同士の関係性を厳密に体系化したものである.また,国際的な疾患オントロジーMONDOへのクロスリファレンスを含む.
$ brew install raptor
$ pipenv install
$ pipenv shell
$ ./setting.sh
- TTL
$ python -m converter
- RDF
$ rapper -i turtle -o rdfxml-abbrev results/nando.ttl > results/nando.rdf
- HTML
$ xsltproc --output results/nando.html data/owl2xhtml.xsl results/nando.rdf
全疾患 | 指定難病 | 小児慢性特定疾病 | |
---|---|---|---|
クラス数 | 2,347 |
1,023 |
1,323 |
英語表記を含むクラス数 | 2,284 |
991 |
1,292 |
疾患定義を含むクラス数 | 1,189 |
333 |
856 |
MONDOへのクロスリファレンスを含むクラス数 | 1,382 |
698 |
684 |
新しい用語のリクエストやクラスの修正依頼,オントロジーに関する問題点・疑問点の報告には,本リポジトリの Issue tracker をご利用ください.
- 「概要、診断基準等」(厚生労働省)(https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000084783.html)
(2020年7月14日に利用) - 「臨床調査個人票」(厚生労働省)(https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000084783.html)
(2020年7月14日に利用) - 小児慢性特定疾病情報センター「概要」(https://www.shouman.jp/disease/search/group/)
(2020年7月14日に利用) - 小児慢性特定疾病情報センター「意見書」(https://www.shouman.jp/disease/search/group/)
(2020年7月14日に利用)
- 本オントロジーの構築に際してDDrareおよびRDVJを参照した.
- 本オントロジーの構築にBioHackathonの成果を利用した.