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Merge branch 'master' of https://github.com/aidrd/nando
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Toyofumi Fujiwara committed Apr 23, 2024
2 parents 22bbd1f + c31ec80 commit 8b72199
Showing 1 changed file with 28 additions and 14 deletions.
42 changes: 28 additions & 14 deletions README.md
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@@ -1,14 +1,17 @@
# NANDO
NANDO(Nanbyo Disease Ontology)は,「指定難病」制度対象の疾患と「小児慢性特定疾病」制度対象の疾患について,国内においてオーソライズされた資料を元に,疾患概念と疾患同士の関係性を厳密に体系化したものである.また,国際的な疾患オントロジー<a href="https://github.com/monarch-initiative/mondo">MONDO</a>へのクロスリファレンスを含む.

## 取得
The Nanbyo Disease Ontology (NANDO) is a structured resource that organizes vocabulary related to rare diseases, the relationships between these diseases, and their connections with other disease resources. Includes cross-references to the international disease ontology, MONDO<a href="https://github.com/monarch-initiative/mondo">MONDO</a>.

## 取得/Down loads
- http://nanbyodata.jp/ontology/nando.ttl
- http://nanbyodata.jp/ontology/nando.rdf

## 参照
## 参照/References
- http://nanbyodata.jp/ontology/nando
- http://bioportal.bioontology.org/ontologies/NANDO

<!--
## 作成
#### 1. 設定 (Macで検証済み)
- `$ brew install raptor`
Expand All @@ -21,30 +24,41 @@ NANDO(Nanbyo Disease Ontology)は,「指定難病」制度対象の疾患
- `$ python -m converter`
1. RDF
- `$ rapper -i turtle -o rdfxml-abbrev results/nando.ttl > results/nando.rdf`
1. HTML
1. HTML\
- `$ xsltproc --output results/nando.html data/owl2xhtml.xsl results/nando.rdf`
## 統計情報
|| 全疾患 | 指定難病 | 小児慢性特定疾病 |
-->

## 統計情報/Statistics
|| 全疾患/All | 指定難病/Designated Intractable Diseases | 小児慢性特定疾病/Specified Chronic Diseases of Children |
| --- | ---: | ---: | ---: |
| クラス数 | `2,347` | `1,023` | `1,323` |
| 英語表記を含むクラス数 | `2,284` | `991` | `1,292` |
| 疾患定義を含むクラス数 | `1,189` | `333` | `856` |
| MONDOへのクロスリファレンスを含むクラス数 | `1,382` | `698` | `684` |
| クラス数/Number of disease | `2,777` | `1,099` | `1,676` |
| MONDOへのクロスリファレンスを含むクラス数/Link to MONDO | `2154` | `892` | `1262` |

## ライセンス
## ライセンス/licens・
<a href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.ja">CC-BY 4.0</a> | <a href="http://dbcls.rois.ac.jp">DBCLS</a>

## コンタクト
新しい用語のリクエストやクラスの修正依頼,オントロジーに関する問題点・疑問点の報告には,本リポジトリの <a href="https://github.com/aidrd/nando/issues">Issue tracker</a> をご利用ください.
## コンタクト/Contact
- 新しい用語のリクエストやクラスの修正依頼,オントロジーに関する問題点・疑問点の報告には,本リポジトリの <a href="https://github.com/aidrd/nando/issues">Issue tracker</a> をご利用ください.

## 出典
- For requests to add new terms, request class modifications, or report issues or questions regarding the ontology, please use the [Issue tracker](https://github.com/aidrd/nando/issues) of this repository.

## 出典/sources
- 「概要、診断基準等」(厚生労働省)(https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000084783.html) <br>(2020年7月14日に利用)
- 「臨床調査個人票」(厚生労働省)(https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/0000084783.html) <br>(2020年7月14日に利用)
- 小児慢性特定疾病情報センター「概要」(https://www.shouman.jp/disease/search/group/) <br>(2020年7月14日に利用)
- 小児慢性特定疾病情報センター「意見書」(https://www.shouman.jp/disease/search/group/) <br>(2020年7月14日に利用)

- Ministry of Health, Labour and Welfare, "Overview, Diagnostic Criteria, etc." (Accessed July 14, 2020)
- Ministry of Health, Labour and Welfare, "Clinical Survey Individual Sheet" (Accessed July 14, 2020)
- Center for Chronic Pediatric Diseases, "Overview" (Accessed July 14, 2020)
- Center for Chronic Pediatric Diseases, "Opinion Paper" (Accessed July 14, 2020)


## 謝辞
## 謝辞/Acknowledgements
- 本オントロジーの構築に際して<a href="https://ddrare.nibiohn.go.jp/">DDrare</a>および<a href="https://metadb.riken.jp/metadb/ontology/RDVJ">RDVJ</a>を参照した.
- 本オントロジーの構築に<a href="http://biohackathon.org/">BioHackathon</a>の成果を利用した.

- The construction of this ontology was informed by references to <a href="https://ddrare.nibiohn.go.jp/">DDrare</a> and <a href="https://metadb.riken.jp/metadb/ontology/RDVJ">RDVJ</a>.
- The results from the <a href="http://biohackathon.org/">BioHackathon</a> were also utilized in building this ontology.

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