Project title

• The MP Japanese Translation Project

Mammalian Phenotype Ontology　日本語訳版

• MGIにおいて作成されたMammalian phenotype ontology（MP）は、マウスの表現型のアノテーションに広く利用されており、日本語化することで、日本における表現型アノテーションの利便性の向上を目指しています。

提供ファイルについて

• MPの日本語訳は、機械翻訳の後、マニュアルキュレーションを実施し、更には専門家による”訳”の確認を行っています。ここでは、マニュアルキュレーション後のデータと、専門家によって確認が終わっているデータの2種類を公開しています。ファイルはTSV、エクセル、ttlで提供しています。

• MPの日本語訳の使用例として、MGIが提供しているAlleleの表現型のデータ及びRGDが提供している系統と遺伝子のデータに、英語ラベルと日本語訳を追加したファイルをUse_caseのフォルダーで提供しています。

Japanese-translation-of-the-Mammalian-phenotype-ontology

• The Mammalian phenotype ontology (MP) created by Mouse Genome Informatics (MGI) is widely used to annotate mouse phenotypes. The translation of MP into Japanese is accelerates phenotypic annotation of genomic data within Japan, promotes the international (re)use of phenotypic annotation produced by Japanese researchers, enables Japanese researchers to readily (re)use internationally annotated phenotypic annotation, and contributes to overall mammalian research.
• Machine translation was first performed, followed by manual curation. Experts were involved in supervising the genetics and medical terminology. We published two types of data: data after manual curation and data confirmed by experts. The files are provided in TSV, Excel, and ttl.

Information

• トーゴーの日においてポスター発表を行いました。
  • 2024年10月5日（土）47番 第2部　「医療情報のデータ統合・共有に役立つ医療オントロジーの日本語化と国際共有について」
• 第71回日本実験動物学会総会において口頭発表を行いました。
  • 2024年5月29日（水）o-32 「Mammalian phenotype ontology(MP)の日本語訳の作成について」

Up date

• 2024/12/05 Use-caseに2024/12のデータを追加しました。
• 2024/10/16 約140Termについて新規日本語訳をExpert versionに追加しました。
• 2024/09/04 新規日本語訳をExpert Versionに追加しました。Use-caseに2024/09のデータを追加しました
• 2024/07/02 manual culationにファイルをアップデートしました。現在新規語彙を追加するために作業を行っておりますが、Expert versionのリリースが遅れる見込みです。
• 2024/03/14 約100Termについて新規日本語訳をExpert Versionに追加しました。
• 2023/12/14 約100Termについて新規日本語訳をExpert Versionに追加しました。
• 2023/07/26 約50Termについて新規日本語訳をExpert Versionに追加しました。
• 2023/05/01 約40Termについて新規日本語訳をExpert versionに追加しました。
• 2023/05/01 Use caseにRGDが提供するRatの系統と及び遺伝子に対するMPのアノテーションデータにMPラベルを付与したファイルを追加しました。

お問い合わせ/フィードバックについて

• お問い合わせについては下記にメールを頂ければ幸いです。
• takatter@××××.rois.ac.jp　(××××の部分は"dbcls"を入れて下さい。)

Sources

• Mammalian-phenotype-ontology

Project members

• Terue Takatsuki(DBCLS)
• Toyofumi Fujiwara(DBCLS)
• Tatsuya Kushida(RIKEN BRC)
• Hiroshi Masuya(RIKEN BRC)
• Eisuke Dohi(NCNP)

License

• CC-BY 4.0