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MTMTM authored Jun 27, 2024
1 parent eb2d42c commit ccada17
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17 changes: 17 additions & 0 deletions _posts/ja/2024-06-27-post4.md
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layout: post
published: true
title: '「TogoVar」のデータアップデートのお知らせ'
tags:
- public_relations
- services
category: ja
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ヒトゲノムバリアントの統合データベース「TogoVar」[https://togovar.org/](https://togovar.org/)では、機能追加、データ拡充を継続的に実施しています。この度、以下のようにデータをアップデートしましたので、お知らせします。<br />

- [理化学研究所](https://www.ims.riken.jp/)が解析した[バイオバンクジャパン](https://biobankjp.org/)第一コホート47疾患のSNPアレイにより決定されたゲノム情報のうち、[45疾患](https://grch38.togovar.org/doc/ja/datasets/jga_snp#diseases_jgad000123)のアレル頻度およびgenotype count(疾患別ならびに男女別)を、疾患ごとの情報として[JGA-SNP](https://grch38.togovar.org/doc/ja/datasets/jga_snp) に追加しました。理化学研究所が解析したgenotypingデータは、NBDCヒトデータベースの[JGAS000114 / JGAD000123](https://humandbs.dbcls.jp/hum0014-latest)として登録されています。

- [ナショナルセンター・バイオバンクネットワーク(NCBN)](https://ncbiobank.org/)がサンプルの収集と全ゲノム解析を実施した9,290人の日本人のアレル頻度およびgenotype countを[NCBNデータセット](https://grch38.togovar.org/doc/ja/datasets/ncbn)として新たに追加しました(GRCh38のみ)。同頻度データはNBDCヒトデータベースのhum0331.v1.freq.v1として登録され[当該データのページ](https://humandbs.dbcls.jp/hum0331-v1#hum0331.v1.freq.v1)からダウンロードできます。

詳細は、TogoVarウェブサイトの[History(更新履歴)](https://grch38.togovar.org/doc/ja/history) をご覧ください。

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