Skip to content

M. Sc. graduate course on phylogeny and algorithmics on sequences (part 1 of 2)

Notifications You must be signed in to change notification settings

dlambert13/alignmentfreeTP1

 
 

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

2 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

Alignment free - TP 1

L'objectif du TP est de comparer 5 especes de bactéries entre elles. Vous trouverez les données en suivant ce lien

Composer le TP

Vous devez forker ce projet puis compléter ses fonctions. Le rendu sera le dépot git dans lequel vous aurrez forké.

Le but est d'obtenir toutes les distances paire à paire des différentes bactéries. Vous pouvez modifier l'affichage final pour obtenir une matrice d'adjacence si vous les souhaitez.

En observant les distances obtenues, que pouvez-vous dire des espèces présentes dans cet échantillon ?

About

M. Sc. graduate course on phylogeny and algorithmics on sequences (part 1 of 2)

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages

  • Python 100.0%