Merge pull request #210 from togoid/main

release 2024-01-23
togoid · Jan 23, 2024 · 150f35c · 150f35c
2 parents 7eb44d9 + 284a187
commit 150f35c
Show file tree

Hide file tree

Showing 3 changed files with 5 additions and 6 deletions.
diff --git a/docs/help.md b/docs/help.md
@@ -1,5 +1,5 @@
 # TogoID ver. 1.1
-Datasets last updated: 2024-01-15
+Datasets last updated: 2024-01-22
 
 ## About
 - [TogoID](https://togoid.dbcls.jp/) is an ID conversion service implementing unique features with an intuitive web interface and an API for programmatic access. TogoID supports datasets from various biological categories such as gene, protein, chemical compound, pathway, disease, etc. TogoID users can perform exploratory multistep conversions to find a path among IDs. To guide the interpretation of biological meanings in the conversions, we crafted an [ontology](https://togoid.dbcls.jp/ontology) that defines the semantics of the dataset relations.
@@ -22,7 +22,7 @@ Shuya Ikeda, Hiromasa Ono, Tazro Ohta, Hirokazu Chiba, Yuki Naito, Yuki Moriya,
 
 - [API Documentation (Swagger)](https://togoid.dbcls.jp/apidoc/)
 
-## Statistics (as of 2024-01-15)
+## Statistics (as of 2024-01-22)
 - Number of target datasets 
     - 102 (from 72 databases)
 - For details on the target DBs and ID examples, please refer to the "DATASETS" tab. 

diff --git a/docs/help_ja.md b/docs/help_ja.md
@@ -1,5 +1,5 @@
 # TogoID ver. 1.1
-Datasets last updated: 2024-01-15
+Datasets last updated: 2024-01-22
 
 ## About
 - [TogoID](https://togoid.dbcls.jp/) は、直感的なインターフェースにより生命科学系データベース(DB)間のつながりを探索的に確認しながらID変換を行うことができるウェブアプリケーションです。同一の実体を指すID間の変換だけでなく、関連する別のカテゴリーのIDへの変換も可能です。また、直接リンクされていないDBのID間でも、他のDBを経由した変換を探索することができます。
@@ -28,7 +28,7 @@ Datasets last updated: 2024-01-15
 
 - [API Documentation (Swagger)](https://togoid.dbcls.jp/apidoc/)
 
-## 統計 (2024-01-15)
+## 統計 (2024-01-22)
 - 対象データセット数 
     - 102 (72のデータベースに由来)
 - 対象DBの詳細やID例については、"DATASETS" タブ からご覧いただけます。 

diff --git a/log/pair_count_history.tsv b/log/pair_count_history.tsv
@@ -21,5 +21,4 @@ Date	affy_probeset-ncbigene	assembly_insdc-bioproject	assembly_insdc-biosample	a
 2023-12-30	19063	1989580	1984072	1916377		2410970	198656	259987	101117	2410970	68557		38153	141392	34314	3091832	8206	11766	1915138	47707	13954	1878362	433124	1439514	2126	12004	11110	33678	3448	8014	8178	1711989	115826	3340026	4019	4849	5671	54210	12180884	14437446	44278	6179217	4924829	12180887	218298	52748677	219677	10179574	141	5046	290	1270	49240	35219	1995	40970	43667	21167	1325		23383	1912	43615	16942	33774	28381	18954	20365	13701	217899	522	104230	275237	8660	220065	129729		111606	59409158	193975949	1533582	1533178	30407	1402682	20191	1283	109057	435537	1275	718778680	199	305	130	12896	47886	12345	137319849	6318	16674	16849	21567	7229	11043		9063	56590	24607	100920	55041	79465	7726	122848	393685	10712	574	1486	8352	9693		10380	2390	9483561	11050619	11556119	25078	85487668	43773		71696	17541	18410	211699	60665296	59361685	42516	6464	32835	49723430	112107	19850	46225	27134	26233	2460780	2804840	4800754	18299774				4319	4337	4316	4298	1192	1798	7832	8040	1685211	726658	530587	339565	341431	1461	4812	141021	2327813	10789	31767	116110427	32308	69387	1252527	2814	620221	1196	264859	12983	40546	332	400679	861452	198020	3335	14362	185	665149	179950008	267549861	227165	57852462	188790	5817042	50390902	57882313	201816	7528	4387	135188	1438	36026464	470711	28283897	329045	31120557	550005	35615159	30437562	27297751	27636085	27640654	27640473	474078	29102112	29426498	29476791	29457753	29431038	28306235	4276	26026	593209	49166	720705	66877211	72473309	287277970	60732887	935843	60001809	692119	173346179	4640572273	2586	10146	65606	39736080	9437437	9647434	9647434	466768100	81875	284374766	230955	13734202	12027805	16106	7021		8188	355933	259506	49539508	251702059	437326	151	505473	11471	951	4013	1361	29837	33518
 2024-01-06	19063	2003442	1997918	1929712		2441819	199634	260578	101333	2441819	68557		38153	141392	34314	3091832	8206	11766	1915138	47707	13954	1878362	433124	1439514	2126	12004	11110	33678	3448	8014	8178	1711989	115826	3340026	4019	4849	5671	54210	12180884	14437446	44278	6179217	4924829	12180887	218298	52748677	219677	10179574	141	5046	290	1270	49240	35219	1995	40970	43667	21167	1325		23383	1912	43615	16942	33774	28381	18954	20365	13701	217899	522	104230	275237	8660	220065	129729		111606	59409158	193975949	1533582	1533178	30407	1402682	20191	1283	109057	435537	1275	718778680	199	305	130	12896	47886	12345	137319849	6318	16674	16849	21567	7229	11043		9063	56590	24607	100994	55041	79465	7727	122855	393800	10712	574	1486	8352	9693		10380	2390	9501433	11074957	11581579	25078	89652984	43773		71696	17541	18412	211701	60744557	59440601	42516	6464	32835	49773087	112107	19850	46228	27134	26233	2460780	2804840	4800754	18299774				4319	4337	4316	4298	1192	1798	7832	8040	1685211	726658	530587	339565	341431	1461	4812	141021	2327813	10789	31767	116112134	32308	69387	1252527	2814	620221	1196	264859	12983	40546	332	400679	861452	198020	3335	14362	185	665149	179950008	267549861	227165	57852462	188790	5817042	50390902	57882313	201816	7528	4387	135188	1438	36026464	470936	28310278	329045	31194792	551578	35694120	30501536	27328875	27660234	27671778	27671597	474303	29135880	29451030	29515727	29491521	29463585	28332616	4276	26026	593209	49176	720705	66877211	72473309	287277970	60732887	935843	60001809	692119	173346179	4645672567	2586	10146	65606	39736080	9437437	9647434	9647434	466768100	81875	284374766	230955	13734202	12027805	16106	7021		8188	355933	259506	49539508	251702059	437326	151	505473	11471	951	4013	1361	29837	33518
 2024-01-13	19063	2015882	2010343	1941628		2460063	199849	260780	101985	2460063	68557		38153	141392	34314	3091832	8206	11766	1915138	47707	13954	1878362	433124	1439514	2126	12004	11110	33678	3448	8014	8178	1711989	115826	3340026	4019	4849	5671	55589	12180884	14807292	44278	10441909	4924829	12180887	229689	58134037	219677	14457335	141	5046	290	1270	49240	35219	1995	40970	43667	21167	1325		23383	1912	43615	16942	33774	28381	18954	20365	13701	217899	522	104230	275237	8660	220065	129693		112424	59409158	193975949	1533582	1533178	30407	1402682	20191	1283	109057	435537	1275	718778680	199	305	130	12896	47886	12345	137319849	6318	16674	16849	21567	7229	11043		9063	56590	24607	101041	55041	79465	7729	122873	393875	10712	574	1486	8352	9693		10380	2390	9501432	11074956	11581578	25078	89761563	43773		71691	17541	18416	211702	60799554	59505889	42516	6464	32835	49813830	112107	19850	46228	27133	26233	2460780	2804840	4800754	18299774				4319	4337	4316	4298	1192	1798	7832	8040	1685211	726658	530587	339565	341431	1461	4812	141021	2327813	10789	31767	116123146	32308	69387	1252527	2814	620221	1196	264859	12983	40546	332	400679	861452	198020	3335	14362	185	665149	179950008	267549861	227165	57852462	188790	5817042	50390902	57882313	201816	7528	4387	135188	1438	36026464	471606	28336237	329045	31280195	553418	35780851	30576968	27361366	27685669	27704269	27704088	474973	29170121	29477337	29550412	29525762	29496100	28358575	4276	26026	593209	49176	720705	66877211	72473309	287277970	60732887	935843	60001809	692119	173346179	4660924434	2586	10146	65606	39736080	9437437	9647434	9647434	466768100	81875	284374766	230955	13734202	12027805	16106	7021		8188	355933	259506	49539508	251702059	437326	151	505473	11471	951	4013	1361	29837	33518
-2024-01-19	19063	2015882	2010343	1941628		2460063	199849	260780	101985	2460063	68557		38153	141392	34314	3091832	8206	11766	1915138	47707	13954	1878362	433124	1439514	2126	12004	11110	33678	3448	8014	8178	1711989	115826	3340026	4019	4849	5671	55589	12180884	14807292	44278	10441909	4924829	12180887	229689	58134037	219677	14457335	141	5046	290	1270	49240	35219	1995	40970	43667	21167	1325		23383	1912	43615	16942	33774	28381	18954	20365	13701	217899	522	104230	275237	8660	220065	129693		112424	59409158	193975949	1533582	1533178	30407	1402682	20191	1283	109057	435537	1275	718778680	199	305	130	12896	47886	12345	137319849	6318	16674	16849	21567	7229	11043		9063	56590	24607	101041	55041	79465	7729	122873	393875	10712	574	1486	8352	9693		10380	2390	9501432	11074956	11581578	25078	89761563	43773		71691	17541	18416	211702	60799554	59505889	42516	6464	32835	49813830	112107	19850	46228	27133	26233	2460780	2804840	4800754	18299774				4319	4337	4316	4298	1192	1798	7832	8040	1685211	726658	530587	339565	341431	1461	4812	141021	2327813	10789	31767	116123146	32308	69387	1252527	2814	620221	1196	264859	12983	40546	332	400679	861452	198020	3335	14362	185	665149	179950008	267549861	227165	57852462	188790	5817042	50390902	57882313	201816	7528	4387	135188	1438	36026464	471606	28336237	329045	31280195	553418	35780851	30576968	27361366	27685669	27704269	27704088	474973	29170121	29477337	29550412	29525762	29496100	28358575	4276	26026	593209	49176	720705	66877211	72473309	287277970	60732887	935843	60001809	692119	173346179	4660924434	2586	10146	65606	39736080	9437437	9647434	9647434	466768100	81875	284374766	230955	13734202	12027805	16106	7021		8188	355933	259506	49539508	251702059	437326	151	505473	11471	951	4013	1361	29837	33518
-2024-01-20	19063	2037586	2032046	1963099		2484425	200463	261424	102551	2484425	68557		38153	141392	34314	3091832	8206	11766	1915138	47707	13954	1878362	433124	1439514	2126	12004	11110	33678	3448	8014	8178	1711989	115826	3340026	4019	4849	5671	55589	12180884	14807292	44278	10441909	4924829	12180887	229689	58134037	219677	14457335	141	5046	290	1270	49240	35219	1995	40970	43667	21167	1325		23383	1912	43615	16942	33774	28381	18954	20365	13701	217899	522	104230	275237	8659	220065	129765		112440	59409158	193975949	1533582	1533178	30407	1402682	20191	1283	109057	435537	1275	718778680	199	305	130	12896	47931	12345	137319849	6318	16674	16849	21567	7229	11043		9063	56588	24607	101132	55041	79465	7736	122892	394027	10712	574	1486	8352	9693		10380	2390	9501516	11074948	11581557	25078	90758182	43773		71691	17541	18424	211705	61006046	59754549	42516	6464	32835	50006853	112107	19850	46229	27132	26233	2460780	2804840	4800754	18299774				4319	4337	4316	4298	1192	1798	7832	8040	1685211	726658	530587	339565	341431	1461	4812	141021	2327813	10789	31767	116125060	32308	69387	1252527	2814	620221	1196	264859	12983	40546	332	400679	861452	198020	3335	14362	185	665149	179953801	267506896	227296	59313578	188971	5815771	51648876	59343570	201816	7528	4387	135188	1438	36026464	471985	28363505	329045	31466398	554936	35968624	30647702	27407218	27711078	27750121	27749940	475352	29262799	29512814	29646305	29618440	29544011	28385843	4276	26026	593209	49189	386593	66877211	72473309	287277970	60732887	935843	60001809	692119	173346179	4667522274	2586	10146	65606	39736080	9437437	9647434	9647434	466768100	81875	284374766	230955	13734202	12027805	16106	7021		8188	355933	259506	49539508	251702059	437326	151	505473	11471	951	4013	1361	29837	33518
+2024-01-20	19063	2037586	2032046	1963099		2484425	200463	261424	102551	2484425	68557		38153	141392	34314	3091832	8206	11766	1915138	47707	13954	1878362	433124	1439514	2126	12004	11110	33678	3448	8014	8178	1711989	115826	3340026	4019	4849	5671	55589	12180884	14807292	44278	10441909	4924829	12180887	229689	58134037	219677	14457335	141	5046	290	1270	49240	35219	1995	40970	43667	21167	1325		23383	1912	43615	16942	33774	28381	18954	20365	13701	217899	522	104230	275237	8659	220065	129765		112440	59409158	193975949	1533582	1533178	30407	1402682	20191	1283	109057	435537	1275	718778680	199	305	130	12896	47931	12345	137319849	6318	16674	16849	21567	7229	11043		9063	56588	24607	101132	55041	79465	7736	122892	394027	10712	574	1486	8352	9693		10380	2390	9501516	11074948	11581557	25078	90758182	43773		71691	17541	18424	211705	61006046	59754549	42516	6464	32835	50006853	112107	19850	46229	27132	26233	2460780	2804840	4800754	18299774				4319	4337	4316	4298	1192	1798	7832	8040	1685211	726658	530587	339565	341431	1461	4812	141021	2327813	10789	31767	116125060	32308	69387	1252527	2814	620221	1196	264859	12983	40546	332	400679	861452	198020	3335	14362	185	665149	179953801	267506896	227296	59313578	188971	5815771	51648876	59343570	201816	7528	4387	135188	1438	36026464	471985	28363505	329045	31466398	554936	35968624	30647702	27407218	27711078	27750121	27749940	475352	29262799	29512814	29646305	29618440	29544011	28385843	4276	26026	593209	49189	386593	66877211	72473309	287277970	60732887	935843	60001809	692119	173346179	4667522274	2586	10146	65606	39736080	9437437	9647434	9647434	466768100	81875	284374766	230955	13734202	12027805	16106	7021		8188	355933	259506	49539508	251702059	437326	151	505473	11471	951	4013	1361	29837	33518